飞行装甲服「IS＜InfiniteStratos＞」原本只有女性能够使用，而主角织斑一夏是全世界唯一一个能使用它的男性，也因此被迫就读IS操纵者的养成学校「IS学园」。一夏身为全校独一无二的男学生，校园生活将会掀起什幺样的波澜!?