这是个人类与森林，以及如同神明般的「尊主」共存之时代。忍者一族的百夜和斑丸背叛了忍村，犯下动摇国本的「重罪」…忍众与尊主，以及背叛的两人，为了实现各自的宏愿，双方发生激烈的冲突！